Entregables

Los reportes entregados en el Proyecto Integrador

Lo que el equipo ha entregado en el Proyecto Integrador, en orden cronológico: el reporte de cada avance y el análisis que lo respalda. Cada reporte se escribe en Quarto y se renderiza a PDF con typst; el .qmd fuente vive junto al PDF en el repositorio, así que cualquier cifra del documento se puede rastrear hasta el notebook que la produjo.

El calendario completo de entregas está en la tabla de fases de CRISP-ML(Q) del Avance 0.

Avance 0 · Propuesta de proyecto

Entregado el 27 de septiembre de 2026 · 17 páginas · descargar PDF

Análisis: no tiene notebook; es la propuesta y la auditoría preliminar de los datos.

Formulación del problema, objetivos, involucrados y auditoría preliminar de calidad de los datos. Corresponde a la fase 1 de CRISP-ML(Q), entendimiento del negocio y de los datos.

Define la arquitectura de dos etapas —permeabilidad de la barrera hematoencefálica y actividad neuroprotectora— y fija una precisión de diseño que condiciona todo lo demás: la etapa 1 no opera como filtro duro sobre la etapa 2, porque un resultado BBB− no descarta al compuesto. También establece la explicabilidad a nivel de subestructura como requisito no negociable de la patrocinadora, y contiene el calendario de entregas del proyecto mapeado contra las fases de CRISP-ML(Q).

Avance 1 · Análisis exploratorio de datos

Entregado el 4 de octubre de 2026 · 15 páginas · descargar PDF

EDA del conjunto de permeabilidad BBB curado por la patrocinadora.

Análisis: notebook del EDA de permeabilidad, el entregable formal de la actividad, y su compañero EDA de actividad en SNC, que hace lo mismo para la etapa 2 y no es un entregable aparte.

Sus tres resultados —el tamaño efectivo es menor que el número de filas, las categorías A–D no son una escala de calidad y los productos naturales cruzan la barrera menos— están desarrollados con sus cifras en los datos del proyecto.

Avance 2 · Ingeniería de características

Entregable formal: notebook ejecutado de principio a fin, con fecha de entrega del 11 de octubre. El PDF es un reporte complementario y permanece en borrador mientras se integran los comentarios del EDA y se consultan las decisiones pendientes (issue #24).

Análisis: notebook de características: descriptores, fingerprints, partición por andamio, normalización y selección de características.

El EDA se extiende una semana, en paralelo con el cierre documental de ingeniería de características; no se pospone el notebook, que ya está ejecutado. El escalamiento medido se aplica a la regresión logística por convergencia y se omite en los árboles. Qué entradas necesitan el criterio de la patrocinadora está en la Ruta, que es la lista única: aquí no se repite, porque dos listas de lo mismo se desincronizan.

Las integraciones de registro de corridas, manifiesto de datos y pruebas del flujo (#67, #71 y #73) refuerzan la trazabilidad sin alterar las salidas científicas del notebook. También se integró el registro retrospectivo de las mediciones de escalamiento y del vocabulario Sort & Slice de tamaño L, con sus parámetros, métricas y entorno.

Avance 3 · Modelo de referencia

Entregado el 18 de octubre: notebooks/03_Baseline.ipynb. Las tres canalizaciones candidatas de la 1.5 sobre las dos fases, con validación cruzada agrupada por estructura y desglose por estrato de procedencia.

Tres cosas que deja establecidas, y que condicionan cómo se leen las cifras siguientes:

• Ninguna canalización gana. Los intervalos del 95% se solapan; con una configuración por familia, declarar un ganador sería prematuro. Afinar es del Avance 4.
• El criterio de agrupamiento pesa más que la elección de modelo. Agrupar solo por andamio, en vez de unirlo al esqueleto de conectividad, infla el AUROC 2.2 puntos y el MCC 6.2 — más de lo que separa a las tres familias entre sí.
• El desempeño de la fase 2 no es un número. Por estrato de procedencia: 0.855 de AUROC donde solo hay ChEMBL y 0.607 donde solo hay NPASS, que son los productos naturales que el proyecto existe para priorizar.

La prueba reservada no se ha mirado.

Próximas entregas

Entrega	Fecha	Fase de CRISP-ML(Q)
Avance 4 · Modelos alternativos	25 de octubre	Ingeniería del modelo (b)
Avance 5 · Ensambles	1 de noviembre	Ingeniería del modelo (c)