Marco teórico
Los fundamentos del proyecto, en tres partes
Los fundamentos del proyecto, en tres partes. Se construyó a partir de siete ramas de investigación documentadas en docs/referencias/, que conservan la evidencia completa y las advertencias de acceso sobre cada fuente.
Si un término no se entiende, el glosario lo define sin suponer formación previa en química ni en aprendizaje automático.
Lo que la patrocinadora y los asesores plantearon de viva voz está en las notas de la reunión del 22 de septiembre; varias decisiones del proyecto salen de ahí y no de la literatura.
Las tres partes
1 · Biología de la barrera y de la enfermedad
Qué es la barrera hematoencefálica y por qué bloquea a la mayoría de los fármacos; qué enfermedades neurodegenerativas se quieren atacar y sobre qué dianas moleculares; y por qué los productos naturales son el punto de partida de este proyecto.
No supone conocimiento de modelado. Es la entrada natural para quien viene de ciencias de la computación.
2 · Métodos computacionales
Cómo se predice actividad biológica a partir de la estructura química —la tradición QSAR, sus principios de validación y sus trampas— y cómo se convierte una molécula en una tabla que un modelo pueda consumir: descriptores, fingerprints y representaciones aprendidas.
No supone conocimiento de química. Es la entrada natural para quien viene de bioingeniería.
3 · Modelado, explicabilidad y hueco identificado
Qué se ha publicado en aprendizaje automático sobre permeabilidad BBB, cómo se justifica una predicción a nivel de subestructura, y qué trabajo no existe todavía y este proyecto pretende hacer.
Es la parte menos desarrollada, y a propósito queda visible: son los capítulos donde el proyecto aporta algo propio y donde falta trabajo.
Estado
Borrador para revisión del equipo y los asesores. Antes de entregar hay que verificar contra doi.org toda referencia marcada como de acceso parcial o sin acceso: varias entradas tienen metadatos que nadie del equipo ha leído.
La bibliografía completa está en bibliografia.bib, con 210 entradas. Cada documento de docs/referencias/ incluye la lista de lo que no se pudo verificar para su ámbito.